La raréfaction de la ressource en eau du fait des usages et du dérèglement climatique conduit à s'intéresser davantage aux nappes captives, ces nappes d'eau profondes anciennes (parfois 30.000 ans) d'eau très pure parce que non connectées à la surface les préservant ainsi de la pollution avec pour corollaire de n'être pas rechargeables. Le sud aquitain contient dans son sous-sol un volume énorme de nappes captives.
Pour un usage vertueux de ces nappes, Institution Adour porte un projet de Schéma d'Aménagement et de Gestion des Eaux (SAGE) des eaux souterraines de Gascogne, en émergence, couvrant un large périmètre de 19.000 kms2 s'étendant sur 1283 communes de Gascogne, du sud-Gironde au sud des Landes.
La CLE du SAGE Adour-Aval a donné le 11 décembre 2024 un avis favorable pour qu'Institution-Adour ait le statut d'Etablissement Public Territorial de Bassin.